Kloning og ekspression af termofile proteiner fra archaea vira

Det overordnede formål med dette projekt er at undersøge, hvordan virusproteiner påvirker værtsorganismen – i dette tilfælde den termofile (’varmeelskende’) archaea Sulfolobus. Det vil ske ved at klone virusgener fra sulfolobus i E. coli-bakterier og derefter føre virusgenerne tilbage til Sulfolobus under kontrollerede forhold.
Forskere har længe interesseret sig for de såkaldte archaea-mikroorganismer, der trives i ekstreme temperaturer, lav pH-værdi og/eller høje saltkoncentrationer. Archaea anses for at være Jordens ældste, mest oprindelige organismer. De ligner i udseende og biologi bakterier, men afviger alligevel stærkt på en række punkter.
Sulfolobus er en modelorganisme indenfor den undergruppe af Archaea der består af hypertermofile (’varmeelskende’) organismer (vokser ved temperaturer mellem 70° - 105 °C). En del af disse organismer er endvidere meget pH-tolerante og tåler meget sure omgivelser.
Enzymer fra de hypertermofile organismer er interessante for bioteknologiske og industrielle processer på grund af deres høje stabilitet under ekstreme forhold (temperatur, pH-værdi og saltkoncentration) – forhold der normalt ødelægger enzymer.
Om projektet
Projektet undersøger kendte og ukendte virusproteiner og deres eventuelle indflydelse på væksten af værtsorganismen Sulfolobus. Ingen af de vira der til dato er fundet i archaea har vist sig at have indflydelse på andre organismer, men metoderne hvorved de inficerer og påvirker værten kan muligvis overføres til andre systemer og dermed øge den generelle forståelse af virus.

Vi benytter os af særlige DNA-klonings-teknikker og forskellige metoder til proteinoprensning, hvor de studerende involveret i projektet kommer til at arbejde med nye teknikker, der bygger ovenpå den viden og de teknikker, de allerede kender. Da mange af proteinerne er ukendte, vil der blive lagt stor vægt på metodeudvikling ved oprensningen. Resultater og metoder vil blive formidlet i videnskabelige tidsskrifter og vil løbende blive inddraget i undervisningen.